性能
由于Hibernate比Mybatis抽象封装的程度更高，理论上单个语句执行的性能会低一些。
但Hibernate会设置缓存，对于重复查询有一定的优化，而且从编码效率来说，Hibernate 的编码效果肯定是会高一点的。
ORM
Hibernate 是完备的 ORM 框架，是符合 JPA 规范的，但 MyBatis 不是。MyBatis 比单纯写 JDBC 肯定是方便一点，但无可避免还是要写SQL，且无法做到跨数据库 。Hibernate 使用 JPA 就可以无需考虑数据库的兼容性问题。
使用 Hibernate 的一个难点是，如何来设计对象之间的关系。如果是关系型数据库的话，表和表是通过外键来进行关联的。而在 ORM 中，则需要从面向对象的角度出发，来设计对象之间的关联关系。
Hibernate着力点对象和对象之间的关系；Mybatis着力于POJO与SQL之间的映射关系。
SPring集成
Spring 以及 Spring Boot 官方都没有针对 MyBatis 有具体的支持，但对 Hibernate 的集成一直是有的。
开发难度
Hibernate的开发难度大于Mybatis、Spring Data。主要由于Hibernate封装了完整的对象关系映射机制，以至于内部的实现比较复杂庞大，学习周期长。
Mybatis主要依赖于SQL的编写与ResultMap的映射
Spring Data易上手，通过命名规范、注解查询简化查询操作
查询
简单查询：Hibernate 提供了基础的查询方法，也可以根据具体的业务编写相应的SQL
Mybatis需要手动编写SQL语句，Spring Data 继承基础接口,可使用内置的增删改查方法
高级查询:Hibernate通过对象映射机制,开发者无需关心SQL的生成与结果映射,专注业务流程；Mybatis需要通过手动在XML文件中编写SQL语句以及ResultMap或者注解,Spring Data 提供了命名规范查询和注解查询更简便的编写想要的SQL。
扩展性
Hibernate与数据库具体的关联都在XML中，所以HQL对具体是用什么数据库并不是很关心
Mybatis由于所有SQL都是依赖数据库书写的，所以扩展性，迁移性比较差
Spring Data 与数据具体的关联可以通过命名规范查询、注解查询,无需关心数据库的差异,但是通过本地化SQL查询的话,就不易扩展。
缓存机制
相同点：Hibernate和Mybatis的二级缓存除了采用系统默认的缓存机制外，都可以通过实现你自己的缓存或为其他第三方缓存方案，创建适配器来完全覆盖缓存行为。
不同点：Hibernate的二级缓存配置在SessionFactory生成的配置文件中进行详细配置，然后再在具体的表-对象映射中配置是那种缓存。
MyBatis的二级缓存配置都是在每个具体的表-对象映射中进行详细配置，这样针对不同的表可以自定义不同的缓存机制。并且Mybatis可以在命名空间中共享相同的缓存配置和实例，通过Cache-ref来实现。
Spring Data 可以通过自己的缓存或者第三方缓存方案,配置满足自己业务需要的缓存行为。
总结
Hibernate 对数据库提供了较为完整的封装,封装了基本的DAO层操作,有较好的数据库移植性
Mybatis 可以进行更细致的SQL优化,查询必要的字段,但是需要维护SQL和查询结果集的映射,而且数据库的移植性较差,针对不同的数据库编写不同的SQL
Spring Data JPA 极大的简化了数据库访问,可以通过命名规范、注解的方式较快的编写SQL
